階層的クラスター分析

概要

階層的クラスター分析 (Hierarchical Cluster Analysis, HCA)はクラスタ間の「距離」 を分析する手法です.「距離」が近いクラスタを順次まとめ, 階層構造を生成します.

操作手順

開始画面またはサイドメニューからHierarchical Cluster Analysisをクリックします . クリックすると以下の画面が表示されます.

上部ナビ上のSettingsより設定ペインの開閉を行うことができます. 目のアイコンが 開いているとき, クリックすると設定ペインを閉じることができます. 逆に目のアイコ ンが閉じている時, クリックすると設定ペインを開くことができます.

画面左に表示される設定ペインからは以下の項目を設定することができます.

設定	概要	必須
Input CSV file	入力CSVファイルパスを指定します.	o
Plot a heatmap?	オンの時はヒートマップを出力します. オフの時は樹形図のみ出力します.	o
Distance method	距離関数を指定します.	o
Color	各分類ラベルの色を指定します. オフの時は黒になります.	x
Plot width, Plot height	プロットサイズを指定します.	x
Plot horizontally?	オンの時は横向きの樹形図を出力します.	x
Label size	ラベルの文字の大きさを指定します.	x

設定後, Runボタンをクリックします. Runボタンをクリックすると, ライブラリのインストールとHCAが実行されます.

実行が終わると樹形図またはヒートマップが表示されます.

プロットは右クリックメニューから保存が可能です. Save Imageメニューをクリック するとダウンロードフォルダに画像が保存されます. Save Image As...メニューをク リックすると保存先を指定することができます.ただし, 保存時に.svgと拡張子をつけ ていただく必要がございます.

また, プロット下部に元ファイルのパスが表示されます.こちらのファイルを別ディレク トリへコピーすることでも, プロットを保存することができます. 元ファイルは一 時ディレクトリに保存されています.一時フォルダはシステム終了時に削除されます (ソフトウェア終了時には削除されません).